杀菌剂又称杀生剂、杀菌灭藻剂、杀微生物剂等，通常是指能有效地控制或杀死水系统中的微生物——细菌、真菌和藻类的化学制剂。在国际上，通常是作为防治各类病原微生物的药剂的总称。
按照杀菌机理可分为氧化性杀菌
剂和非氧化性杀菌剂两大类。氧化性杀菌剂通常为强氧化剂，主要通过与细菌体内代谢酶发生氧化作用而达到杀菌目的。常用氧化性杀菌剂有氯气、二氧化氯、溴、臭氧、过氧化氢等。非氧化性杀菌剂是以致毒剂的方式作用于微生物的特殊部位，从而破坏微生物的细胞或者生命体而达到杀菌效果，常见非氧化性杀菌剂有氯酚类、异噻唑啉酮、季铵盐类等。
杀菌剂按来源分，除农用抗生素属于生物源杀菌剂外，主要的品种都是化学合成杀菌剂，杀菌剂是一类用来防治植物病害的药剂。凡是对病原物有杀死作用或*生长作用，但又不妨碍植物正常生长的药剂，统称为杀菌剂。杀菌剂可根据作用方式、原料来源及化学组成进行分类。
按应用领域分为工业杀菌剂及农业杀菌剂两种。
反渗透杀菌剂工业应用领域
在工业循环冷却水中的应用
1、季铵盐类杀菌剂：十二烷基二甲基苄基氯化铵、十二烷基二甲基苄基溴化铵、十四烷基二甲基苄基氯化铵、聚季铵盐等
2、含氯杀菌剂：氯气、二氧化氯、二氯异氰尿酸钠(优氯净)、三氯异氰尿酸钠等。
3、过氧化物杀菌剂：双氧水、过氧乙酸等
4、唑啉类：异噻唑啉酮、苯并异噻唑啉酮等
5、醛类：戊二醛等
